Resirkulering akvakultur systemer, RAS, er en oppdrettsteknologi for fisk der fysiokjemiske og biologiske faktorer veves tett sammen. Essensielt er bruk av biofilter der bakterier håndterer fiskens ekskresjonsprodukter. I dag produseres 30% av smolt i RAS anlegg i Norge, og fiskebiomassen kan være så høy som 500 kg fisk/m3. For å korte ned oppholdstiden for laks i åpen sjø, og for å kunne drette flere arter, utvikler RAS teknologien seg nå videre fra ferskvannsmiljø til marint miljø, noe som gir nye utfordringer innen mikrobiologi, kartlegging av toleranseverdier og krav til utstyr. I prosjektet ”MONITOR” ønsker vi å studere og identifisere mikroorganismene i et marint/brakkvanns RAS for post-smolt med tanke på fiskehelse. Verktøyet vi bruker er hentet fra økologien, der vi bruker molekylærbiologiske metoder med PCR markør-gen og moderne Ion Torrent sekvensering, slik at samfunnet blir kartlagt med veldig høy oppløsning. Vi kan derfor også være med å kaste lys over den helhetlige mikrobiologien i anlegget. Her vil vi presentere data for et helt års drift, relativt tidlig i anleggets driftshistorie. Mikroorganismene som ble tilført anlegget og biofilteret ved oppstart og restart brukes som utgangspunkt for forståelse av suksesjon og tilkomst av ”ikke-tilsatte” mikrober. Det siste innbefatter også nærværet av sår-bakterien Tenacibaculum.